Вона дбала про виховання хлопчика і віддала його до школи. Блаженний Михайло Клопский, зустрів одного разу на вулиці Івана і передбачив, що він буде архієпископом Новгорода.
Іоанн прийняв постриг в Отенской пустелі, у п'ятдесяти кілометрах від міста, був ігуменом цієї обителі, звідки новгородці в 1458 році обрали його в архієпископи. Святитель Іона користувався великою повагою в Москві, і в його святительство московські князі не зазіхали на незалежність Новгорода. Архієпископ Іона побудував перший на новгородській землі храм на честь Преподобного Сергія Радонезького в 1463 році.
Дбаючи про відродження традицій новгородської церковної старовини, він викликав у Новгород відомого упорядника житій святих Пахомія Логофета, який написав, на підставі місцевих джерел, служби і житія найбільш відомих новгородських святих. До цього часу відноситься початок підстави Соловецького монастиря. Святитель Іона надав велику допомогу та сприяння влаштуванню обителі.
Преподобного Зосиму він видав особливу грамоту, за якою віддавав, разом з мирською владою Новгорода, у володіння нової обителі весь Соловецький острів. Після багатьох трудів святитель, відчуваючи наближення своєї смерті, написав духовний заповіт, в якому просив поховати його тіло в Отенской обителі. 5 листопада 1470 року, причастивши Святих Таїн, святитель відійшов до Господа.
