На цій стадії турніру зіграють 20 команд — 14 переможців матчів 2-го раунду Кубка і шість команд УПЛ — Ворскла, Карпати, Зірка, Сталь, Маріуполь і Верес, передає Ukr.Media. Вони були поділені на 10 пар.
Авангард Д2 — Д1 Ворскла
Колос Д2 — Д1 Маріуполь
Сталь Д1 — Перлина Д2
Інгулець Д1 — Арсенал-Київ Д1
Дніпро-1 Д3 — Гірник-Спорт Д2
Таврія Д3 — Зірка Д1
Демня А — Львів Д3
Прикарпаття Д3 — Карпати Д1
Агробізнес Д3 — Верес Д1
Гельос Д2 — Десна Д2
Першу лігу представляють вісім клубів — Геліос, Перлина, Гірник-Спорт, Арсенал-Київ, Десна, Інгулець, Колос, Авангард. З Другої ліги у 3-й раунд Кубка України потрапили Агробізнес, Прикарпатті, Дніпро-1, Львів і Таврія. Також в цей раунд вийшов і аматорський колектив Демня.
Базова дата проведення матчів 3-го раунду Кубка України – 20 вересня.
У разі, якщо зійдуться команди з ліг різного рангу, то гра буде проходити на полі тієї з них, яка виступає в нижчому дивізіоні.